MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 90347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009484	TGC	2	6	207915	207920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259203
5002	NC_009484	GGA	2	6	207979	207984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259203
5003	NC_009484	CGCTGG	2	12	208059	208070	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148259203
5004	NC_009484	GCT	3	9	208114	208122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259203
5005	NC_009484	GC	3	6	208127	208132	0 %	0 %	50 %	50 %	148259203
5006	NC_009484	GC	3	6	208151	208156	0 %	0 %	50 %	50 %	148259203
5007	NC_009484	CTG	2	6	208196	208201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259203
5008	NC_009484	TGC	2	6	208215	208220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259203
5009	NC_009484	GCT	2	6	208222	208227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259203
5010	NC_009484	CCGG	2	8	208234	208241	0 %	0 %	50 %	50 %	148259203
5011	NC_009484	GAC	2	6	208243	208248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259203
5012	NC_009484	TGG	2	6	208287	208292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259203
5013	NC_009484	CTG	2	6	208322	208327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259203
5014	NC_009484	CGC	2	6	208328	208333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259203
5015	NC_009484	CG	3	6	208344	208349	0 %	0 %	50 %	50 %	148259203
5016	NC_009484	CGG	2	6	208375	208380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259203
5017	NC_009484	ACC	2	6	208400	208405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259203
5018	NC_009484	GTG	2	6	208406	208411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259203
5019	NC_009484	CGCC	2	8	208414	208421	0 %	0 %	25 %	75 %	148259203
5020	NC_009484	GCC	3	9	208424	208432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259203
5021	NC_009484	GGC	3	9	208435	208443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259203
5022	NC_009484	GGT	2	6	208444	208449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259203
5023	NC_009484	GTG	2	6	208505	208510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259203
5024	NC_009484	CTG	2	6	208514	208519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259203
5025	NC_009484	TCGC	2	8	208541	208548	0 %	25 %	25 %	50 %	148259203
5026	NC_009484	GC	3	6	208569	208574	0 %	0 %	50 %	50 %	148259203
5027	NC_009484	CGG	2	6	208576	208581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259203
5028	NC_009484	GCC	2	6	208630	208635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259203
5029	NC_009484	CTCGGC	2	12	208661	208672	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259203
5030	NC_009484	CGG	2	6	208674	208679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259203
5031	NC_009484	TCG	3	9	208698	208706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259203
5032	NC_009484	CCTCG	2	10	208714	208723	0 %	20 %	20 %	60 %	148259203
5033	NC_009484	TCG	2	6	208773	208778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259203
5034	NC_009484	TCA	3	9	208800	208808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259203
5035	NC_009484	GGCGCG	2	12	208823	208834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259203
5036	NC_009484	GC	3	6	208935	208940	0 %	0 %	50 %	50 %	148259203
5037	NC_009484	TGG	2	6	208944	208949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259203
5038	NC_009484	GGC	3	9	208966	208974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259203
5039	NC_009484	GCC	2	6	209094	209099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259204
5040	NC_009484	GCG	2	6	209100	209105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259204
5041	NC_009484	CCG	2	6	209118	209123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259204
5042	NC_009484	GGC	2	6	209146	209151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259204
5043	NC_009484	CG	3	6	209162	209167	0 %	0 %	50 %	50 %	148259204
5044	NC_009484	GCTC	2	8	209252	209259	0 %	25 %	25 %	50 %	148259204
5045	NC_009484	CGG	3	9	209289	209297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259204
5046	NC_009484	CGC	2	6	209303	209308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259204
5047	NC_009484	GCG	6	18	209403	209420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259204
5048	NC_009484	CGCGG	2	10	209438	209447	0 %	0 %	60 %	40 %	148259204
5049	NC_009484	AGCG	2	8	209471	209478	25 %	0 %	50 %	25 %	148259204
5050	NC_009484	GCG	2	6	209481	209486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259204
5051	NC_009484	CG	3	6	209516	209521	0 %	0 %	50 %	50 %	148259204
5052	NC_009484	CAT	2	6	209540	209545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259204
5053	NC_009484	CGA	2	6	209557	209562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259204
5054	NC_009484	GCCG	2	8	209563	209570	0 %	0 %	50 %	50 %	148259204
5055	NC_009484	CCG	2	6	209597	209602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259204
5056	NC_009484	CGG	2	6	209610	209615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259204
5057	NC_009484	GCGG	2	8	209626	209633	0 %	0 %	75 %	25 %	148259204
5058	NC_009484	CGCC	2	8	209639	209646	0 %	0 %	25 %	75 %	148259204
5059	NC_009484	CGC	2	6	209699	209704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259204
5060	NC_009484	CGC	5	15	209753	209767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259204
5061	NC_009484	GCG	2	6	209864	209869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259204
5062	NC_009484	CGC	2	6	209880	209885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259204
5063	NC_009484	GC	3	6	209884	209889	0 %	0 %	50 %	50 %	148259204
5064	NC_009484	CGC	2	6	209933	209938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259204
5065	NC_009484	TCC	2	6	210090	210095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259205
5066	NC_009484	GGC	2	6	210199	210204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
5067	NC_009484	CCG	2	6	210295	210300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259205
5068	NC_009484	CGGCG	2	10	210325	210334	0 %	0 %	60 %	40 %	148259205
5069	NC_009484	GGC	2	6	210410	210415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
5070	NC_009484	GCG	2	6	210433	210438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
5071	NC_009484	TG	3	6	210530	210535	0 %	50 %	50 %	0 %	148259205
5072	NC_009484	CCG	2	6	210562	210567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259205
5073	NC_009484	GCGCG	3	15	210570	210584	0 %	0 %	60 %	40 %	148259205
5074	NC_009484	ATG	2	6	210585	210590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259205
5075	NC_009484	GCC	2	6	210633	210638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259205
5076	NC_009484	GGC	2	6	210652	210657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
5077	NC_009484	CGA	2	6	210689	210694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259205
5078	NC_009484	GC	3	6	210701	210706	0 %	0 %	50 %	50 %	148259205
5079	NC_009484	GCG	2	6	210720	210725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
5080	NC_009484	CAA	2	6	210845	210850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259205
5081	NC_009484	CAA	2	6	210854	210859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259205
5082	NC_009484	GCG	2	6	210898	210903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
5083	NC_009484	AGC	2	6	210904	210909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259205
5084	NC_009484	GCC	2	6	210914	210919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259205
5085	NC_009484	GCCT	2	8	210927	210934	0 %	25 %	25 %	50 %	148259205
5086	NC_009484	GCTCG	2	10	210935	210944	0 %	20 %	40 %	40 %	148259205
5087	NC_009484	CG	3	6	210953	210958	0 %	0 %	50 %	50 %	148259205
5088	NC_009484	GC	3	6	210985	210990	0 %	0 %	50 %	50 %	148259205
5089	NC_009484	CGA	2	6	210995	211000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259205
5090	NC_009484	GAC	2	6	211044	211049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259205
5091	NC_009484	GAG	2	6	211089	211094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259205
5092	NC_009484	GCG	2	6	211106	211111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
5093	NC_009484	TGA	2	6	211147	211152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259205
5094	NC_009484	GCC	2	6	211182	211187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259205
5095	NC_009484	GC	3	6	211220	211225	0 %	0 %	50 %	50 %	148259205
5096	NC_009484	CCG	2	6	211240	211245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259205
5097	NC_009484	CGC	2	6	211250	211255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259205
5098	NC_009484	ACG	2	6	211279	211284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259205
5099	NC_009484	CGA	2	6	211322	211327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259205
5100	NC_009484	CGC	2	6	211337	211342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259205
5101	NC_009484	CGC	2	6	211346	211351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259205
5102	NC_009484	GCT	2	6	211370	211375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259205
5103	NC_009484	GCT	2	6	211406	211411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259205
5104	NC_009484	TGC	2	6	211471	211476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259205
5105	NC_009484	GAG	3	9	211497	211505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259205
5106	NC_009484	CG	3	6	211533	211538	0 %	0 %	50 %	50 %	148259205
5107	NC_009484	GGC	2	6	211619	211624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
5108	NC_009484	GGA	2	6	211673	211678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259205
5109	NC_009484	AGG	2	6	211699	211704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259205
5110	NC_009484	CAC	2	6	211742	211747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259205
5111	NC_009484	CAC	2	6	211789	211794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259205
5112	NC_009484	CGG	2	6	211810	211815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
5113	NC_009484	ACC	2	6	211830	211835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259205
5114	NC_009484	GCC	2	6	211836	211841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259205
5115	NC_009484	GCT	2	6	211844	211849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259205
5116	NC_009484	GC	3	6	211853	211858	0 %	0 %	50 %	50 %	148259205
5117	NC_009484	GAA	2	6	211982	211987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259205
5118	NC_009484	GTG	2	6	212007	212012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259205
5119	NC_009484	GAT	2	6	212024	212029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259205
5120	NC_009484	CGG	2	6	212032	212037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
5121	NC_009484	CCG	2	6	212042	212047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259205
5122	NC_009484	GCG	2	6	212050	212055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
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5125	NC_009484	GCG	2	6	212116	212121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259205
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5231	NC_009484	GGCG	2	8	215523	215530	0 %	0 %	75 %	25 %	148259207
5232	NC_009484	GCGA	2	8	215566	215573	25 %	0 %	50 %	25 %	148259207
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5240	NC_009484	TGC	2	6	215804	215809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259207
5241	NC_009484	GCG	2	6	215836	215841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
5242	NC_009484	GCG	2	6	215867	215872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
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5244	NC_009484	CGC	2	6	215939	215944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259207
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5366	NC_009484	CTCG	2	8	219811	219818	0 %	25 %	25 %	50 %	148259211
5367	NC_009484	CCTG	2	8	219828	219835	0 %	25 %	25 %	50 %	148259211
5368	NC_009484	GC	3	6	219838	219843	0 %	0 %	50 %	50 %	148259211
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5481	NC_009484	CGC	2	6	223344	223349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
5482	NC_009484	GGCC	2	8	223362	223369	0 %	0 %	50 %	50 %	148259214
5483	NC_009484	ATG	2	6	223375	223380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259214
5484	NC_009484	CGAG	2	8	223383	223390	25 %	0 %	50 %	25 %	148259214
5485	NC_009484	CCCGCC	2	12	223407	223418	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	148259214
5486	NC_009484	CGC	2	6	223429	223434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
5487	NC_009484	TGG	2	6	223439	223444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259214
5488	NC_009484	CAGCAC	2	12	223468	223479	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148259214
5489	NC_009484	CGC	2	6	223542	223547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
5490	NC_009484	CCG	2	6	223584	223589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
5491	NC_009484	CCG	2	6	223603	223608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
5492	NC_009484	GTCG	2	8	223635	223642	0 %	25 %	50 %	25 %	148259214
5493	NC_009484	AGC	2	6	223665	223670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259214
5494	NC_009484	CCG	3	9	223746	223754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
5495	NC_009484	GC	3	6	223755	223760	0 %	0 %	50 %	50 %	148259214
5496	NC_009484	CGTCGC	2	12	223771	223782	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259214
5497	NC_009484	CTC	2	6	223849	223854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259214
5498	NC_009484	CGC	5	15	223876	223890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
5499	NC_009484	TGA	2	6	223892	223897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259214
5500	NC_009484	GCA	2	6	223914	223919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259214

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